геом_дотплот с десятичными значениями

#r #ggplot2

Вопрос:

У меня есть некоторые проблемы с функцией точечной диаграммы, применяемой к моим данным. Я мог бы воспроизвести проблему, используя данные о бриллиантах. Проблема в том, что некоторые разные значения сгруппированы вместе, в то время как их не должно быть. Например, две желтые точки («J») выровнены вместе, тогда как одна равна 64, а другая-63,8. Есть еще одно значение 63,8, окрашенное как «E», которое находится чуть ниже. Я хотел бы что-то более точное в соответствии со значением. Кажется, что значения округляются и что иногда эти значения разделяются на несколько строк. Я не вижу проблемы с другими данными (см. Пример 2).

Пример 1

 data("diamonds") dia=diamonds[1:30,] dia[order(dia$depth, decreasing = TRUE), ]   carat cut color clarity depth table price x y z 9 0.22 Fair E VS2 65.1 61 337 3.87 3.78 2.49 11 0.30 Good J SI1 64.0 55 339 4.25 4.28 2.73 19 0.30 Good J SI1 63.8 56 351 4.23 4.26 2.71 22 0.23 Very Good E VS2 63.8 55 352 3.85 3.92 2.48 18 0.30 Good J SI1 63.4 54 351 4.23 4.29 2.70 5 0.31 Good J SI2 63.3 58 335 4.34 4.35 2.75 21 0.30 Good I SI2 63.3 56 351 4.26 4.30 2.71 6 0.24 Very Good J VVS2 62.8 57 336 3.94 3.96 2.48 12 0.23 Ideal J VS1 62.8 56 340 3.93 3.90 2.46 20 0.30 Very Good J SI1 62.7 59 351 4.21 4.27 2.66 27 0.24 Premium I VS1 62.5 57 355 3.97 3.94 2.47 4 0.29 Premium I VS2 62.4 58 334 4.20 4.23 2.63 7 0.24 Very Good I VVS1 62.3 57 336 3.95 3.98 2.47 14 0.31 Ideal J SI2 62.2 54 344 4.35 4.37 2.71 28 0.30 Very Good J VS2 62.2 57 357 4.28 4.30 2.67 17 0.30 Ideal I SI2 62.0 54 348 4.31 4.34 2.68 8 0.26 Very Good H SI1 61.9 55 337 4.07 4.11 2.53 1 0.23 Ideal E SI2 61.5 55 326 3.95 3.98 2.43 23 0.23 Very Good H VS1 61.0 57 353 3.94 3.96 2.41 16 0.32 Premium E I1 60.9 58 345 4.38 4.42 2.68 30 0.23 Very Good F VS1 60.9 57 357 3.96 3.99 2.42 29 0.23 Very Good D VS2 60.5 61 357 3.96 3.97 2.40 13 0.22 Premium F SI1 60.4 61 342 3.88 3.84 2.33 26 0.23 Very Good G VVS2 60.4 58 354 3.97 4.01 2.41 15 0.20 Premium E SI2 60.2 62 345 3.79 3.75 2.27 2 0.21 Premium E SI1 59.8 61 326 3.89 3.84 2.31 10 0.23 Very Good H VS1 59.4 61 338 4.00 4.05 2.39 24 0.31 Very Good J SI1 59.4 62 353 4.39 4.43 2.62 25 0.31 Very Good J SI1 58.1 62 353 4.44 4.47 2.59 3 0.23 Good E VS1 56.9 65 327 4.05 4.07 2.31 gt;   
 ggplot(dia, aes(y=depth, x=""))    geom_boxplot()    geom_dotplot(aes(fill=factor(color)), binaxis='y', stackdir='center', dotsize=0.5, stackgroups = TRUE)   

введите описание изображения здесь

With other data (see below) that I created to see better what was happening, the problem doesn’t exist anymore

Example 2

 abb=c(1,1.5,1.5,1.5,2,2,2,2.5,3.5,5,5,5.5,5.5) bcc=c("Lyon", "Lyon", "Bordeaux", "Bordeaux", "Chambéry", "Lyon", "Lyon", "Nantes", "Nantes", "Lyon", "Lyon", "Rennes", "Lyon") Fil=data.frame(abb,bcc)  gt; Fil  abb bcc 1 1.0 Lyon 2 1.5 Lyon 3 1.5 Bordeaux 4 1.5 Bordeaux 5 2.0 Chambéry 6 2.0 Lyon 7 2.0 Lyon 8 2.5 Nantes 9 3.5 Nantes 10 5.0 Lyon 11 5.0 Lyon 12 5.5 Rennes 13 5.5 Lyon   

с помощью точечной диаграммы I значения 5 и 5,5 группируются вместе. Я хотел бы то же самое, но с разными «строками» для этих значений

 ggplot(Fil, aes(y=abb, x=""))    geom_boxplot()    geom_dotplot(aes(fill=factor(bcc)), binaxis='y', stackdir='center', dotsize=0.5, stackgroups = TRUE)     scale_fill_manual(values = c("#FF8000", "#FF0033","#80FF00","#FFFF00", "#000000"))  

введите описание изображения здесь

Каково решение этой проблемы ?

Комментарии:

1. Я попробовал geom_jitter, но точки не так хорошо центрированы, как в dotplot, и я предпочитаю такой вид представления.

2. Извините, я забыл, код ggplot, я отредактировал свой пост

3. Что вы имеете в виду под линиями? Линии блокпоста? Или цвет контура точек?

4. «Линии» — это линии, образованные точками, выровненными вместе. В моем первом примере две желтые точки со стрелкой находятся на одной «линии», в то время как у них не совсем одинаковое значение (64 и 63,8). И точка чуть ниже находится на второй «линии», в то время как она имеет то же значение, что и одна из желтых точек (63,8). Я хотел бы иметь «линию» по точному значению.

5. Итак, ваш второй пример-это то, что вы хотите и правильно?

Ответ №1:

Вам просто нужно изменить binwidth . Перед тем, как я изменил binwidth , я получил сообщение от ggplot о выборе binwidth . В сообщении, которое я получал, говорилось

Ширина ячейки по умолчанию составляет 1/30 диапазона данных. Выберите лучшую стоимость с binwidth помощью .

ggplot2 я говорил тебе, что binwidth в этом и была проблема

 ggplot(dia, aes(y=depth, x=""))    geom_boxplot()    geom_dotplot(aes(fill=factor(color)), binaxis='y', stackdir='center', dotsize=0.5, stackgroups = TRUE,binwidth = 0.2)  

пример

Фиксация ширины бункера-это просто повязка. Я думаю, что использование geom_jitter может быть хорошей альтернативой

Комментарии:

1. Я думаю, что вы дали ответ, здесь нет необходимости в дрожании, просто потому, что значения никогда не накладываются друг на друга, а уже сложены рядом друг с другом. Оператору все равно нужно установить ширину ячейки, просто чтобы определить, к какой строке она относится.

2. Спасибо! Смена мусорного ведра решила мои проблемы. Действительно, я видел это сообщение, но я не изменил его в лучшую сторону. Не могли бы вы объяснить мне, почему лучше использовать geom_jitter, так как теперь у меня есть то, что я хочу ?

3. geom_jitter создает некоторые небольшие изменения в ваших точках данных и полезен, если у вас есть много одинаковых значений, которые нанесены друг на друга. Но иногда вам просто хочется увидеть плотность точек. Таким образом, они случайным образом адаптируются с небольшим значением вариации. Вы не хотите и не нуждаетесь в дрожании. вы хотите даже противоположного, просто основываясь на вашей корзине. Если они попадают в одну и ту же корзину, ваши точки не накладываются друг на друга, но они складываются слева направо, поэтому дрожание не требуется.