Блог

Я хочу автоматически подсчитывать ячейки, и обычно я делаю это с помощью ImageJ

Я могу открыть imagej с помощью подпроцесса

 subprocess.Popen(r"pathImageJImageJ.exe")  

Я хочу загрузить изображение в imagej с python

Затем запустите макрос imagej (редактирует файл изображения и устанавливает пороговое значение) из python, используя этот код:

 subprocess.Popen(r"pathij153-win-java8ImageJmacrosautocount.ijm")  

Как я могу открыть изображение в ImageJ с помощью python? Полный код:

 #import libraries import subprocess  #open imageJ subprocess.Popen(r"pathij153-win-java8ImageJImageJ.exe")  #open file in imageJ   #open imageJ macro subprocess.Popen(r"pathij153-win-java8ImageJmacrosautocount.ijm")