#r #ggplot2 #boxplot #p-value #significance
Вопрос:
Я создал этот график, и мне нужно добавить скобки уровня значимости между лошадьми «Современного» и «римского» в каждом аспекте. Я попробовал geom_signif, но смог заключить в скобки только группы «Современные» и «Римские», а не каждые две лошади. Кто-нибудь может помочь, пожалуйста?
Это мои данные:
Element log_cs species group
1 A 1.0921481 Horse Modern
2 A 1.0920578 Horse Modern
3 A 1.0990291 Horse Modern
4 A 1.1489135 Horse Modern
5 A 1.1017859 Horse Modern
6 A 1.0845620 Horse Modern
7 A 1.0289420 Horse Modern
8 A 1.1027259 Horse Modern
9 A 1.1091967 Horse Modern
10 A 1.1854781 Horse Modern
11 A 1.0999498 Horse Roman
12 A 1.0944261 Horse Roman
13 A 1.0956034 Horse Roman
14 A 1.0751165 Horse Roman
15 A 1.0841038 Horse Roman
16 A 1.1073352 Horse Roman
17 A 1.0776306 Horse Roman
18 A 1.1109054 Horse Roman
19 A 1.1231977 Horse Roman
20 A 1.1026371 Horse Roman
21 A 1.0917204 Horse Roman
22 A 1.0938320 Hybrid Modern
23 A 1.0659731 Hybrid Modern
24 A 1.1226732 Hybrid Modern
25 A 1.1170249 Hybrid Modern
26 A 1.0667190 Hybrid Modern
27 A 1.0944956 Hybrid Modern
28 A 1.0728841 Hybrid Modern
29 A 1.0827132 Hybrid Modern
30 A 1.0676629 Hybrid Modern
31 A 1.1269550 Hybrid Modern
32 A 1.0835485 Hybrid Modern
33 A 1.0874964 Hybrid Roman
34 A 1.1309169 Hybrid Roman
35 A 1.1144295 Hybrid Roman
36 A 1.1065604 Hybrid Roman
37 A 1.1164547 Hybrid Roman
38 A 1.1373446 Hybrid Roman
39 A 1.1069174 Hybrid Roman
40 A 1.0949513 Hybrid Roman
41 B 1.0485633 Horse Modern
42 B 1.0238247 Horse Modern
43 B 1.0427080 Horse Modern
44 B 1.1040061 Horse Modern
45 B 1.0325064 Horse Modern
46 B 1.0275794 Horse Modern
47 B 0.9587948 Horse Modern
48 B 1.0328241 Horse Modern
49 B 1.0428645 Horse Modern
50 B 1.1462359 Horse Modern
51 B 0.9758035 Horse Roman
52 B 1.0268603 Horse Roman
53 B 1.0564401 Horse Roman
54 B 1.0345251 Horse Roman
55 B 1.0230175 Horse Roman
56 B 1.0013129 Horse Roman
57 B 0.9865836 Horse Roman
58 B 1.0191887 Horse Roman
59 B 1.0413617 Horse Roman
60 B 1.0264960 Horse Roman
61 B 1.0342843 Horse Roman
62 B 0.9960231 Hybrid Modern
63 B 0.9920178 Hybrid Modern
64 B 1.0588670 Hybrid Modern
65 B 1.0337936 Hybrid Modern
66 B 1.0343635 Hybrid Modern
67 B 1.0218588 Hybrid Modern
68 B 0.9024005 Hybrid Modern
69 B 1.0408433 Hybrid Modern
70 B 1.0493235 Hybrid Modern
71 B 1.0251871 Hybrid Modern
72 B 1.0311694 Hybrid Modern
73 B 1.0390529 Hybrid Roman
74 B 1.0356013 Hybrid Roman
75 B 1.0751427 Hybrid Roman
76 B 1.0300296 Hybrid Roman
77 B 1.0393642 Hybrid Roman
78 B 1.0240472 Hybrid Roman
79 B 1.0772711 Hybrid Roman
80 B 1.0607907 Hybrid Roman
81 B 1.0651311 Hybrid Roman
и это код, который я использовал для блок-схемы
box_test <- ggplot(test, aes(x = group, y = log_cs))
facet_wrap(~Element)
geom_boxplot(aes(fill=species), position=position_dodge(.9),
outlier.size = 1, outlier.alpha = 0.5, show.legend = TRUE)
Ответ №1:
Вы ищете такое решение?
library(tidyverse)
library(ggsignif)
ggplot(df, aes(x = group, y = log_cs))
facet_wrap(~Element)
geom_boxplot(aes(fill=species), position=position_dodge(.9),
outlier.size = 1, outlier.alpha = 0.5, show.legend = TRUE)
geom_signif(comparisons = list(c("Modern", "Roman")),
map_signif_level=TRUE)
stat_compare_means(aes(group=species), label = "p.signif", label.y = 1.2)
Комментарии:
1. Это то, что я сделал, Но я хочу сравнить только красные вместе (Лошадь/Лошадь) в каждой грани, а не группы «Современные» и «Римские»