#r #bioinformatics #bioconductor
Вопрос:
Я выполняю дифференциальный сплайсинг с помощью rMATS, за которым следует пакет maser R, в котором я получаю свои значимые гены. Но проблема в том, что я не могу извлечь этот список генов.
volcano(hypoxia_filt, fdr = 0.05, deltaPSI = 0.1, type = "SE")
Я мог бы сгенерировать график вольвано, но мне нравится извлекать список генов, также используя те же условия. Но я не знаю.
class(hypoxia_filt)
[1] "Maser"
attr(,"package")
[1] "maser" here
isS4(hypoxia_filt)
[1] TRUE
Комментарии:
1. Пожалуйста, проясните вашу конкретную проблему или предоставьте дополнительные сведения, чтобы точно указать, что вам нужно. Поскольку это написано в настоящее время, трудно точно сказать, о чем вы просите.