#bioinformatics #blast
Вопрос:
Когда я запускал blastn v2.12.0 в многопоточном режиме (-num_thread 24), разделенный запросом(-mt_mode 1), у меня возникла следующая ошибка:
завершение вызывается после создания экземпляра ‘std::length_error’ что(): базовая строка::_M_create
для суперкомпьютера (ОС RHEL 7/cent) это произошло, но для собственной ubuntu v18.0.4 этого не произошло.
Команда Blast не отвечает, поэтому я разместил это здесь.
большое спасибо
Комментарии:
1. кстати, это алгоритм blastn-task, более медленная версия для низких идентификационных совпадений.
2. Это может иметь какое-то отношение к конфигурации вашего сервера. Некоторые процессы могут не поддерживать многопоточность на нескольких узлах.
3. Это не несколько узлов, а только один узел.