geom_smooth, похоже, не соответствует методу method=»glm» с методом.аргументы правильно

#r #ggplot2 #methods #glm

Вопрос:

Я пытаюсь подогнать линию glm с помощью geom_smooth, но подгонка кажется неправильной. Я получаю очень прямую линию. Я ожидал бы небольшой кривой к линии подгонки, так как я использую «обобщенную линейную модель», а не линейную.

Вот как выглядит моя структура данных:

  $ treatment        : int  -20 -20 -40 -60 -60 -60 0 -100 -100 -40 ...
 $ response         : int  267 253 254 253 257 242 250 274 295 255 ...
 $ early_late       : Factor w/ 2 levels "early","late": 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 ...
 

И мой код:

 ggplot()   
  geom_point(data = data, mapping = aes(x= treatment, y= response, color=early_late, fill = early_late), shape = 21, size = 2.5, alpha = 0.15)   
   scale_y_continuous(breaks=seq(120,320, 40),  limits=c(120, 320))   
  labs(x= "treatment",
       y = "response (count)")  
  geom_smooth(data = data, mapping = aes(x= treatment, y= response, color = early_late), method = "glm", method.args = list(family= poisson),   formula = y ~ x, se = T) 
 

Любые идеи по этому поводу будут очень оценены!

введите описание изображения здесь

Комментарии:

1. Пожалуйста, поделитесь своими данными с помощью dput() .

2. glm линейны, попробуйте лесс или gam для нелинейной подгонки