Pytorch: «Ошибка ключа: Обнаружена ошибка ключа в рабочем процессе загрузки данных 0».

#machine-learning #image-processing #pytorch #custom-dataset

Вопрос:

описание проблемы:

Я пытаюсь загрузить данные изображения с помощью пользовательского набора данных Pytorch. Я немного углубился и обнаружил, что мой набор изображений состоит из 2 типов фигур (512,512,3) и (1024,1024) . Мое предположение состоит в том, что по вышеуказанной причине он выдает ошибку ниже.

Примечание: Код способен считывать некоторые изображения, но для некоторых из них он выдает приведенное ниже сообщение об ошибке. Это послужило причиной для небольшого анализа данных изображений и показало, что в наборе данных было 2 разных изображения.

Вопрос 1. Как предварительно обработать такие данные изображения для обучения?

Q2. Есть ли какие-либо другие причины, по которым я могу видеть приведенное ниже сообщение об ошибке?

Сообщение об ошибке:

 KeyError                                  Traceback (most recent call last)
<ipython-input-163-aa3385de8026> in <module>
----> 1 train_features, train_labels = next(iter(train_dataloader))
  2 print(f"Feature batch shape: {train_features.size()}")
  3 print(f"Labels batch shape: {train_labels.size()}")
  4 img = train_features[0].squeeze()
  5 label = train_labels[0]

 ~/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/utils  /data/dataloader.py in __next__(self)
519             if self._sampler_iter is None:
520                 self._reset()
521             data = self._next_data()
522             self._num_yielded  = 1
523             if self._dataset_kind == _DatasetKind.Iterable and 

~/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py in _next_data(self)
1201             else:
1202                 del self._task_info[idx]
1203                 return self._process_data(data)
1204 
1205     def _try_put_index(self):

~/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py in _process_data(self, data)
1227         self._try_put_index()
1228         if isinstance(data, ExceptionWrapper):
1229             data.reraise()
1230         return data
1231 

~/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/_utils.py in reraise(self)
423             # have message field
424             raise self.exc_type(message=msg)
425         raise self.exc_type(msg)
426 
427 

KeyError: Caught KeyError in DataLoader worker process 0.
Original Traceback (most recent call last):
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/pandas  /core/indexes/base.py", line 2898, in get_loc
return self._engine.get_loc(casted_key)
File "pandas/_libs/index.pyx", line 70, in pandas._libs.index.IndexEngine.get_loc
File "pandas/_libs/index.pyx", line 101, in pandas._libs.index.IndexEngine.get_loc
File "pandas/_libs/hashtable_class_helper.pxi", line 1032, in    pandas._libs.hashtable.Int64HashTable.get_item
File "pandas/_libs/hashtable_class_helper.pxi", line 1039, in   pandas._libs.hashtable.Int64HashTable.get_item
KeyError: 16481

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/_utils/worker.py", line 287, in _worker_loop
data = fetcher.fetch(index)
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/_utils/fetch.py", line 44, in fetch
data = [self.dataset[idx] for idx in possibly_batched_index]
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/_utils/fetch.py", line 44, in <listcomp>
data = [self.dataset[idx] for idx in possibly_batched_index]
File "<ipython-input-161-f38b78d77dcb>", line 19, in __getitem__
img_path =os.path.join(self.img_dir,self.image_ids[idx])
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/series.py", line 882, in __getitem__
return self._get_value(key)
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/series.py", line 990, in _get_value
loc = self.index.get_loc(label)
File "/home/ec2-user/anaconda3/envs/pytorch_p36/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 2900, in get_loc
raise KeyError(key) from err
KeyError: 16481
 

Код:

 from torchvision.io import read_image
import torch
from torchvision import transforms
from sklearn.model_selection import train_test_split
from torch.utils.data import Dataset

class CustomImageDataset(Dataset):
     # init
    def __init__(self,dataset,transforms=None,target_transforms=None):
        #self.train_data = pd.read_csv("Data/train_data.csv")
        self.image_ids = dataset.image_id
        self.image_labels = dataset.label
        self.img_dir = 'Data/images'
        self.transforms = transforms
        self.target_transforms = target_transforms
# len
    def __len__(self):
        return len(self.image_ids)
# getitem
    def __getitem__(self,idx):
        # image path
        img_path =os.path.join(self.img_dir,self.image_ids[idx])
        # image
        image = read_image(img_path)
        label = self.image_labels[idx]
    # transform image
        if self.transforms:
             image = self.transforms(image)
    # transform target
        if self.target_transforms:
             label = self.target_transforms(label)
    return image, label
 

Код: train_data-это объект pandas csv-файла, который имеет идентификатор изображения, информацию labesl.

   from sklearn.model_selection import train_test_split
  X_train, X_test = train_test_split(train_data, test_size=0.1, random_state=42)
  train_df = CustomImageDataset(X_train)
  train_dataloader = torch.utils.data.DataLoader(
        train_df,
        batch_size=64,
        num_workers=1,
        shuffle=True,
    )
 

Ответ №1:

обнаружена проблема с кодом.

Пользовательская функция загрузки данных Pytorch «getitem» использует idx для извлечения данных, и я предполагаю, что она знает диапазон idx из функции len, например: 0, до len(строки в наборе данных).

В моем случае у меня уже был набор данных panda (train_data) с idx в качестве одного из столбцов. Когда я случайным образом разделил его на X_train и X_test, несколько строк данных были перенесены в X_test вместе с идентификатором.

Теперь, когда я отправляю X_train пользовательскому загрузчику данных, он пытается получить идентификатор строки с идентификатором, и этот идентификатор просто оказывается в наборе данных X_test. Это приводит к ошибке keyerror: 16481, т. е. строка с idx=16481 отсутствует в наборе данных X_train. Он был перемещен в X_test во время разделения.

фу…

Комментарии:

1. Ты спасла мне день. Я также индексировал на основе индекса фрейма данных, и df_train, очевидно, не хватало некоторых ограничений после разделения. Мне нужно было только сбросить значение_index при создании наборов данных.

Ответ №2:

Я получил ту же ошибку при точной настройке модели на основе трансформаторов DistilBertModel в PyTorch при замене ее головки.

Я забыл сбросить индексы train_dataframe и test_dataframe после train_test_split, что привело CustomDataset к неправильному индексированию.