#r #pdf #r-markdown
Вопрос:
Я работаю с языком программирования R. Я учусь конвертировать «rmarkdown» в pdf с помощью Rstudio. Я следую этому уроку здесь: https://rmarkdown.rstudio.com/articles_intro.html
Я впервые создал новый файл Rmarkdown:
Затем я ввел следующий текст в редактор Rmarkdown:
---
output: html_document
---
This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see .
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
```{r}
summary(cars)
```
You can also embed plots, for example:
```{r, echo=FALSE}
plot(cars)
```
Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.
Затем я нажал «Связать в PDF».:
But this did not work and returned the following message:
processing file: testfile.Rmd
|.......... | 14%
ordinary text without R code
|.................... | 29%
label: setup (with options)
List of 1
$ include: logi FALSE
|.............................. | 43%
ordinary text without R code
|........................................ | 57%
label: cars
|.................................................. | 71%
ordinary text without R code
|............................................................ | 86%
label: pressure (with options)
List of 1
$ echo: logi FALSE
|......................................................................| 100%
ordinary text without R code
output file: testfile.knit.md
"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" RTS -K512m -RTS testfile.utf8.md --to latex --from markdown autolink_bare_uris tex_math_single_backslash --output testfile.tex --lua-filter "C:UsersmeOneDriveDocumentsRwin-library4.0rmarkdownrmarkdownluapagebreak.lua" --lua-filter "C:UsersmeOneDriveDocumentsRwin-library4.0rmarkdownrmarkdownlualatex-div.lua" --self-contained --highlight-style tango --pdf-engine pdflatex --variable graphics --variable "geometry:margin=1in"
Error: LaTeX failed to compile testfile.tex. See https://yihui.org/tinytex/r/#debugging for debugging tips.
In addition: Warning messages:
1: In has_crop_tools() :
Tool(s) not installed or not in PATH: pdfcrop, ghostcript
-> As a result, figure cropping will be disabled.
2: In system2(..., stdout = if (use_file_stdout()) f1 else FALSE, stderr = f2) :
'"pdflatex"' not found
Execution halted
No LaTeX installation detected (LaTeX is required to create PDF output). You should install a LaTeX distribution for your platform: https://www.latex-project.org/get/
If you are not sure, you may install TinyTeX in R: tinytex::install_tinytex()
Otherwise consider MiKTeX on Windows - http://miktex.org
MacTeX on macOS - https://tug.org/mactex/
(NOTE: Download with Safari rather than Chrome _strongly_ recommended)
Linux: Use system package manager
Может кто-нибудь, пожалуйста, показать мне, что я делаю не так? Есть ли простой способ конвертировать Rmarkdown в PDF?
Спасибо
Примечание: Информация о сеансе
> sessionInfo()
R version 4.0.3 (2020-10-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 19043)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252 LC_CTYPE=English_Canada.1252
[3] LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_Canada.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_4.0.3 htmltools_0.5.1.1 tools_4.0.3 yaml_2.2.1
[5] tinytex_0.30 rmarkdown_2.7 knitr_1.31 digest_0.6.27
[9] xfun_0.21 rlang_0.4.10 evaluate_0.14
Комментарии:
1. Сделайте это:
install.packages('tinytex')
иtinytex::install_tinytex()
строка за строкой, затем перезапустите R и RStudio и скажите мне.2. @ TarJae : спасибо за ваш ответ! Я попробовал это и получил следующую ошибку:
3. Ошибка: LaTeX не удалось скомпилировать tesst.tex. Видишь yihui.org/tinytex/r/#debugging для советов по отладке. Кроме того: Предупреждающие сообщения: 1: В has_crop_tools() : Инструмент(ы) не установлен или не указан в ПУТИ: pdfcrop, ghostcript -> В результате обрезка рисунка будет отключена. 2: В system2(…, stdout = if (use_file_stdout()) f1 еще ЛОЖЬ, stderr = f2) : «pdflatex» не найден Выполнение остановлено
4. ОК. Установите Rtools < cran.r-project.org/bin/windows/Rtools > ВАЖНО: Вы должны убедиться, что флажок установлен, чтобы установщик изменил ваш ПУТЬ, затем установите devtools с помощью >
install.packages("devtools")
. затем повторите то же самое 1.install.packages('tinytex')
затем 2.tinytex::install_tinytex()
5. Попробуйте изменить
output: html_document
output: pdf_document
, если вы хотите связать в формате pdf, а не в формате html.