#python #arrays #list #file #pdb
Вопрос:
У меня есть номер атома(список), имя атома(список), координаты CA(массив), номер остатка(список) и имя остатка(список), которые выводятся/вычисляются в нескольких списках/массивах. Как я мог бы создать файл .pdb со всей этой информацией на Python? Я установил пакет Biopython. Спасибо!
Комментарии:
1. Право, я знаю, что на самом деле понятия не имею, с чего начать, потому что в стеке все решения используют Biopython.
2. Предполагая, что вы думаете о файлах pdb = банка данных белка, поскольку это формат текстового файла, вы можете легко написать его на стандартном Python; но вам нужно полностью понять спецификацию , которая довольно сложна. То есть, если вы не хотите использовать библиотеку, которая уже знает, как выполнить эту задачу за вас 🙂
3. Выходной файл хорош только для того, чтобы включать информацию обо всех C-буквах в части ATOM.
4. Я установил пакет biopython