#r #plot #hierarchical-clustering
Вопрос:
короче говоря, я пытаюсь сделать так, чтобы дендограмма выглядела хорошо, используя объект phylo R в качестве входных данных, проблема в том, что, когда я делаю график, ветви выглядят уплотненными и неясными:
hc1 <- hclust(as.dist(scaled_matrix))
plot(as.phylo(hc1))
Когда я делаю график без преобразования моего иерархического кластера в объект phylo, он выглядит хорошо:
hc1 <- hclust(as.dist(distance_matrix))
plot(hc1)
Но мне нужно, чтобы это был объект phylo для дальнейшей компоновки, например, для создания «веерной» дендограммы и многого другого. Поэтому я подумал, что hang функция может справиться с этим, так как, когда я использую ее на втором графике, ветви выглядят уплотненными, как показано на первой дендограмме, но plot() функция не позволяет добавлять hang = 'number' .
Как я могу сделать так, чтобы ветви выглядели как вторая дендограмма ??