Блог

Главная - Вопросы по программированию - ошибка geom_mark_ellipse при использовании 2 точек

ошибка geom_mark_ellipse при использовании 2 точек

#r #ggplot2 #ggforce

Вопрос:

Эллипс, отмеченный geom_mark_ellipse в ggforce пакете, неправильно работает при использовании двух точек.

Ниже я показываю пример

Данные:

           transecta        MDS1         MDS2              grupo
CLOA1         CLOA1  0.56852742  0.294150091       mmx clausura
CLOA2         CLOA2  0.88257101  0.151361099       mmx clausura
CLOA3         CLOA3  1.05422157  0.202652263  pastizal clausura
CLOA6         CLOA6  0.34475209 -0.168575457       mmx clausura
CLOA7         CLOA7 -0.73184407 -0.277142902        ba clausura
CLOA8         CLOA8 -0.03496517 -0.732031748        ba clausura
OAT1           OAT1 -0.51507135  0.424460141      mmx transecta
OAT2           OAT2 -0.15854319  0.266485510      mmx transecta
OAT3           OAT3 -0.86233409  0.022687344      mmx transecta
OATCOI1     OATCOI1 -0.86519268 -0.004470466       ba transecta
OATCOI3     OATCOI3 -0.86632557  0.230568674       ba transecta
OATCOIEC1 OATCOIEC1 -0.80751803  0.320056234       ba transecta
OATMMX3     OATMMX3 -0.42566740 -0.110641894      mmx transecta
OATMMXEC2 OATMMXEC2 -0.09455770  0.760007755      mmx transecta
OATP1         OATP1  0.36207279  0.424046062 pastizal transecta
OATP2         OATP2  0.56614390  0.470124863 pastizal transecta

Код:

 library(ggplot2);library(ggforce)
gg1<-ggplot(data,aes(x=MDS1,y=MDS2))   
  # stat_contour(data=ordi.AC.na, aes(x=x, y=y, z=z),  binwidth = 5,alpha=0.9)  
  # geom_raster(data=ordi.AC.na, aes(x=x, y=y, fill = z,alpha=0.9))  
  geom_point(aes(color=grupo))   
  geom_mark_ellipse(aes(color=grupo))  
  geom_text_repel(aes(label=transecta,color=grupo))  
  theme_bw()  
  theme(panel.grid.minor.y = element_blank(),
        panel.grid.minor.x = element_blank());gg1

Результат:

РЕЗУЛЬТАТ GGPLOT

Комментарии:

1. Похоже, есть нерешенные проблемы с ggforce, хотя, похоже, они достаточно похожи на ваш случай.

2. Две точки определяют прямую линию, а не кривую, замкнутую или нет. Я говорю это, не взглянув на код, поэтому не стесняйтесь игнорировать мой комментарий.

3. Эллипсы имеют две центральные точки.

Метки: