Блог

У меня возникли проблемы с представлением нескольких переменных в конкретном порядке. По умолчанию я получил переменные в алфавитном порядке, но я хочу упорядочить их в зависимости от их природы (в моем случае показаны сначала климатические переменные, морфологические переменные и, наконец, экологические переменные). Как я могу этого достичь? Вот код, который я использую:

 
pdf("posterior_means.pdf", width=8, height=6)

ggplot(EstimatesMCMC, aes(Predictor, Mean))  
  geom_point()  
  geom_point( colour = 'black', size = 3)  
  labs(y = "Posterior distribution")  
  labs(x = "")  
  theme_bw()  
  theme(text=element_text(size = 12))  
  geom_hline(yintercept=0, linetype="dashed", color = "grey", size=1)  
  coord_flip()  
  geom_pointrange(aes(ymin = `LowerCI`, ymax = `UpperCI`))```

Predictor variables are represented in Y axe, while X axe shows posterior distribution range. 

I really appreaciate any comments
 

OP, у вас есть несколько вариантов сортировки переменных на вашей оси в соответствии с категорией. Это не очень легко продемонстрировать с помощью данных, которыми вы поделились, поэтому я продемонстрирую два метода, используя репрезентативный пример набора данных.

Приведенные ниже данные примера содержат 3 столбца: категория-общая категория для переменной (одна из 3), my_variable-столбец, используемый для оси x. Вы увидите на графике ниже, что ось x расположена в алфавитном порядке, и я покажу вам, как мы можем расположить ее в порядке «категория».

 library(ggplot2)

set.seed(8675309)

df <- data.frame(
  category = sample(c('Category A','Category B','Category C'), 26, replace=TRUE),
  my_variable =LETTERS,
  values = rnorm(26, 10, 5)
)

p <- ggplot(df, aes(x=my_variable, y=values))   geom_col(aes(fill=category))
p
 

Метод 1: Определение уровней в факторе

Порядок меток столбцов будет определяться в первую очередь порядком levels того, является ли это фактором. В противном случае ggplot2 значение по умолчанию будет буквенно-цифровым. Поэтому вы можете задать порядок, преобразовав этот столбец в коэффициент и установив levels= аргумент. В этом случае мы захотим разложить на множители столбец «my_variable». Во-первых, мы хотим привести все в порядок.

 df_ordered <- df %>%
  dplyr::arrange(category)
 

Если вы строите df_ordered так же, как и раньше, вы все равно будете my_variable организованы в алфавитном порядке. Причина в том, что мы не установили этот столбец в качестве фактора. Мы хотим сделать это и указать, что levels= для этого фактора следует использовать порядок, в котором значения отображаются в кадре данных. В этом случае у нас есть только по одному value на каждого my_variable . Если бы у нас было более одного значения для каждого my_variable , мы бы хотели указать каждый элемент my_variable только один раз в levels= аргументе, поэтому я пишу его для более общего использования unique() :

 df_ordered$my_variable <- factor(df_ordered$my_variable,
  levels=unique(df_ordered$my_variable))
 

Теперь, когда вы строите график, порядок определяется порядком уровней фактора df_ordered$my_variable . Мы указали уровни этого фактора в порядке, в котором уровни отображаются в упорядоченном наборе данных, так что теперь это работает нормально:

 ggplot(df_ordered, aes(x=my_variable, y=values))   geom_col(aes(fill=category))
 

Способ 2: Используйте Огранку

Альтернативой настройке уровней и изменению порядка вашего фрейма данных является группировка с помощью графика. Самый простой способ сделать это-огранить свой сюжет.

 p   facet_grid(~category, scales='free_x', space="free_x")
 

Вы все еще можете сделать так, чтобы это «выглядело» немного больше похоже на другой сюжет (без пробелов между ними) с небольшим количеством причудливого форматирования. Вот несколько вариантов, которые, как вы можете видеть, мы можем изменить, чтобы изменить внешний вид финального сюжета:

 p   facet_grid(~category, scales='free_x', space="free_x", switch = "x")  
  theme(
    panel.spacing = unit(0, 'pt'),
    strip.placement = 'outside',
    strip.background = element_rect(fill='NA', color='black'),
    strip.text = element_text(size=11, face='bold')
  )
 

Поиграйте с этими настройками, и вы, вероятно, сможете заставить его выглядеть так, как вы хотите.