snakemake; удаленный модуль из частных репозиториев github; нет доступа?

#github #module #snakemake

#github #модуль #snakemake

Вопрос:

В snakemake я пытаюсь использовать модули из частных репозиториев github, но получаю сообщение «Не удалось открыть исходный файл» / «Ошибка клиента HTTPError: 404: не найдено для url: » когда репозитории являются частными, но не когда они общедоступны. Я понял из документов, что частные репозитории должны быть возможны. Я использовал gh CLI для аутентификации, но на самом деле не уверен, что это необходимо или достаточно. Кто-нибудь может подтвердить, что доступ к частным репозиториям из snakemake должен быть возможен? Кто-нибудь может сказать мне, требуется ли / какая аутентификация?

Спасибо! Ludo

Комментарии:

1. Из кода я почти ожидаю, что они даже не клонируют, просто пытаются извлечь файл в качестве URL. Я бы отправил сообщение о проблеме в репозиторий.

2. Я подал запрос на функцию; github.com/snakemake/snakemake/issues/1301

3. Я открыл PR для реализации этого: github.com/snakemake/snakemake/pull/1761