Использование обобщенных смешанных моделей в R

#r #logistic-regression #mixed-models

#r #логистическая регрессия #смешанные модели

Вопрос:

Я пытаюсь запустить логистическую регрессию, но для предметного проектирования, поэтому в итоге я использовал обобщенную смешанную модель ( glmer и lme функции в R). Существует один предиктор (с 3 условиями) и двоичный результат, кодируемый как 0 или 1.

Мне было интересно, есть ли у кого-нибудь советы о том, какую модель лучше использовать и почему.

У меня также возникают проблемы с интерпретацией выходных данных, и в сводке, похоже, отсутствует одно из трех условий в моем предикторе. Когда я запускаю приведенный ниже код:

 D1_data <- read.table("data", header = TRUE, sep = ",") 
print(D1_data)

library(nlme)
model <- lme(output ~ condition, data = D1_data, random = ~1|participant)

anova(model)
summary(model)


log.model <- glmer(output ~ condition   (1|participant), data=D1_data, family=binomial(link=logit))

summary(log.model)
anova(log.model)
 

Сводка включает только первые два условия (в обоих случаях), например:

 Fixed effects:
               Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept)       40.03     427.04   0.094    0.925
condition1   -39.63     427.04  -0.093    0.926
condition2   -37.07     427.04  -0.087    0.931
 

Хотя должно быть третье условие. В чем здесь проблема?

Комментарии:

1. «Какая модель лучше и почему» и как интерпретировать выходные данные — это статистика, а не программирование, поэтому вопрос будет гораздо более уместным в stats.stackexchange.com а не здесь, при переполнении стека.

2. Как правило, когда у вас есть k уровни категориальной переменной, первый уровень считается «эталонным уровнем», и именно для этого подходит перехват. Все остальные оценки приведены в сравнении с эталонным уровнем.

3.Этот вопрос очень широкий (понимание того, какую модель использовать, почему и для интерпретации выходных данных)… Вероятно, слишком широко для stats.stackexchange.com . Я бы предложил проверить эти ресурсы GLMM в качестве места для начала: bbolker.github.io/mixedmodels-misc/glmmFAQ.html bbolker.github.io/mixedmodels-misc/ecostats_chap.html