Блог

Короче говоря, я пытаюсь взять строку, затем разделить ее на каждые три символа, добавляя эти три символа в массив по мере его выполнения.

Начальный ввод в функцию (RawData) выглядит примерно так:

 ATGCCACTATGGTAG
 

но может различаться по длине.

Я пытаюсь преобразовать приведенные выше данные (представляющие нуклеотиды) в отдельные кодоны следующим образом:

 [ATG,CCA,CTA,TGG,TAG]
 

обратите внимание, что каждый фрагмент из 3 теперь индексируется в массив.
Это мой код:

 public static void codonList(String rawData) {
        int previous = 0;
        String[] codons = new String[rawData.length() / 3];

        for (int i = 0; i < rawData.length(); i  ) {

            previous  ;
            // goes through each
            // split at every third then append to end of codon string
            if (previous % 3 == 0) {
                String chunk = rawData.substring(previous - 3, previous);
                codons[i] = chunk;
                System.out.println(Arrays.toString(codons));
            }
        }

    }
 

и его вывод:

 [null,null,AGT,null,null]
 

Я на 90% уверен, что это простое решение, но, похоже, не могу его понять. Если кто-то может дать некоторое представление, это было бы очень ценно!

У вас есть несколько проблем.

1. вы перебираете всю строку, вы хотите создавать только rawData.length()/3 кодоны.
2. Как намекнул Кевин, получите 3 символа: String chunk = rawData.substring(i*3, i*3 3);
3. выводите массив только после завершения обработки строки.

     public static void codonList(String rawData) {
        String[] codons = new String[rawData.length() / 3];

        for (int i = 0; i < rawData.length() / 3; i  ) {
            // goes through each
            // split at every third then append to end of codon string
            String chunk = rawData.substring(i*3, i*3 3);
            codons[i] = chunk;
        }
        System.out.println(Arrays.toString(codons));
    }
 

Вывод:

[ATG, CCA, CTA, TGG, TAG]