Блог

Я пытаюсь прочитать некоторые данные (имена геномов) из файла ‘.csv’, я хочу найти длину каждого столбца, а затем построить гистограмму с этими данными, но каким-то образом мой скрипт показывает, что все столбцы имеют одинаковую длину, что неверно. У меня есть 4 столбца в моем файле, и в каждой ячейке столбца есть имя генома. Неправильное количество столбцов впоследствии также будет представлено в файле ‘.png’. Я удалил когда-либо значение ‘0’ и в моем файле, но проблема все равно не исчезла. Это мой код :

 import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

ca1 = []
casU3 =[]
casU5 =[]
casBig = []
df = pd.read_csv('statistics.csv')
ca1 = df['1 cassette']
casU3 = df['2-3 cassettes']
casU5 = df['4-5 cassettes']
casBig = df['More then 5 cassettes']
cas1 = len(list(filter(None, ca1)))
casUntil3 = len(list(filter(None, casU3)))
casUntil5 = len(list(filter(None, casU5)))
Bigcas = len(list(filter(None, casBig)))
genomes = cas1   casUntil3   casUntil5   Bigcas
height = [cas1,casUntil3,casUntil5,Bigcas]
bars = ('No.of genomes with only 1 cassette','2-3 cassettes','4-5 cassettes','more than 5 cassettes')
y_pos = np.arange(len(bars))
plt.bar(y_pos, height, tick_label = bars, width = 0.5, color=(0.1, 0.1, 0.1, 0.1),  edgecolor='blue')
plt.ylabel('Number of genomes') 
plt.title('Statistics over %s genomes with CRISPR immune system' %genomes) 
plt.savefig('./histogramCRISPR.png')
plt.show()
 

Код короткий и простой, но почему-то я не могу найти проблему. Пожалуйста, помогите.

Невозможно иметь не равные столбцы, либо столбцы будут иметь значения NaN, либо некоторые или другие значения.

пожалуйста, проверьте наличие значений NaN.

Спасибо.

Непонятно, что столбцы не переходят к столбцам, либо столбцы будут иметь значения NaN, либо несколько или другие значения. Удалите значения Nan с помощью кода:

 df.drop.isna()
 

Вы можете увидеть NAN, который является кодом:

 df.isnull().sum()
 

`