Переписать UDF в pandas udf с помощью столбца ArrayType

#pandas #apache-spark #pyspark #user-defined-functions

#pandas #apache-spark #pyspark #определяемые пользователем функции

Вопрос:

Я пытаюсь переписать UDF в pandas UDF.

Однако, когда дело доходит до столбца с ArrayType внутри. Я изо всех сил пытаюсь найти правильное решение.

У меня есть фрейм данных, как показано ниже:

  ----------- -------------------- 
|      genre|                 ids|
 ----------- -------------------- 
|      Crime|[6, 22, 42, 47, 5...|
|    Romance|[3, 7, 11, 15, 17...|
|   Thriller|[6, 10, 16, 18, 2...|
|  Adventure|[2, 8, 10, 15, 29...|
|   Children|[1, 2, 8, 13, 34,...|
|      Drama|[4, 11, 14, 16, 1...|
|        War|[41, 110, 151, 15...|
|Documentary|[37, 77, 99, 108,...|
|    Fantasy|[2, 56, 60, 126, ...|
|    Mystery|[59, 113, 123, 16...|
 ----------- -------------------- 
 

Следующий UDF работает хорошо:

 pairs_udf = udf(lambda x: itertools.combinations(x, 2), transformer.schema)
df = df.select("genre", pairs_udf("ids").alias("ids"))
 

Вывод выглядит так:

  ----------- -------------------- 
|      genre|                 ids|
 ----------- -------------------- 
|      Crime|[[6, 22], [6, 42]...|
|    Romance|[[3, 7], [3, 11],...|
|   Thriller|[[6, 10], [6, 16]...|
|  Adventure|[[2, 8], [2, 10],...|
|   Children|[[1, 2], [1, 8], ...|
|      Drama|[[4, 11], [4, 14]...|
|        War|[[41, 110], [41, ...|
|Documentary|[[37, 77], [37, 9...|
|    Fantasy|[[2, 56], [2, 60]...|
|    Mystery|[[59, 113], [59, ...|
 ----------- -------------------- 
 

Однако, что было бы эквивалентно при записи функции в pandas udf .

PS: Я понимаю, что в качестве альтернативы я могу использовать перекрестное объединение для достижения тех же результатов.

Но мне больше интересно, как pandas udf обрабатывает столбец с помощью ArrayType.

Комментарии:

1. может быть, что-то вроде lambda row: row.apply(lambda x: itertools.combinations(x, 2))

2. спасибо, @mck, это была одна из моих попыток. теперь я думаю, что проблема, с которой я столкнулся, больше связана java.lang.UnsupportedOperationException: sun.misc.Unsafe or java.nio.DirectByteBuffer.<init>(long, int) not available . после нескольких поисков в Google, похоже, это связано с поддержкой java 11 и spark-arrow. который может относиться к отдельному вопросу.

Ответ №1:

Я собираюсь поделиться своими выводами здесь:

есть 3 аспекта, чтобы заставить pandas udf работать для вашего проекта:

1. pandas UDF, или, точнее, Apache Arrow, не поддерживает сложные типы, как это делает обычный udf.(по состоянию pyspark 3.0.1 на , pyarrow 2.0.0 )

например:

2. если вы используете Java 11, которая используется по умолчанию в (py) Spark 3. вам необходимо добавить следующее как часть вашей конфигурации spark:

 spark.driver.extraJavaOptions='-Dio.netty.tryReflectionSetAccessible=true'
spark.executor.extraJavaOptions='-Dio.netty.tryReflectionSetAccessible=true'
 

это решит java.lang.UnsupportedOperationException проблему, упомянутую выше.

3. убедитесь, что путь python вашей виртуальной среды добавлен в ваш pyspark_python

т.е. environ['PYSPARK_PYTHON']='./your/virtual/enviroment/path'