#python
#python
Вопрос:
я создал скрипт, который будет вычислять, может ли набор фрагментов белка образовывать определенную последовательность на основе их веса, что дало мне следующий результат:
combinations =
[(484.5, 1036.3, 2267.6),
(397.5, 2267.6, 475.6, 647.7),
(484.5, 1036.3, 811.9, 1455.7),
(397.5, 475.6, 811.9, 647.7, 1455.7)]
каждый элемент представляет собой набор фрагментов, которые имеют тот же вес, что и белок, который я ищу.
теперь я знаю, какие фрагменты имеют какой вес, и превратил это в словарь:
{3125.4: 'SKEPFKTRIDKKPCDHNTEPYMSGGNY',
1963.4: 'KMITKARPGCMHQMGEY',
397.5: 'AINV',
484.5: 'QIQD',
1036.3: 'YAINVMQCL',
2267.6: 'IEEATHMTPCYELHGLRWV',
475.6: 'MQCL',
1724.0: 'HMTPCYELHGLRWV',
2000.2: 'DHTAQPCRSWPMDYPLT',
811.9: 'IEEATHM',
1397.7: 'MVGKMDMLEQYA',
681.8: 'GWPDII',
647.7: 'QIQDY',
2174.4: 'TPCYELHGLRWVQIQDYA',
1794.0: 'HGLRWVQIQDYAINV',
1040.3: 'KKKNARKW',
1455.7: 'TPCYELHGLRWV'}
есть ли какой-либо способ использовать словарь, чтобы дать мне такой результат:
[('IEEATHMTPCYELHGLRWV', 'QIQD', 'YAINVMQCL'),
('IEEATHMTPCYELHGLRWV', 'QIQDY', 'AINV', 'MQCL'),
('IEEATHM', 'TPCYELHGLRWV', 'QIQD', 'YAINVMQCL'),
('IEEATHM', 'TPCYELHGLRWV', 'QIQDY', 'AINV', 'MQCL')]
для элементов в комбинациях?
Комментарии:
1. Пожалуйста, укажите свой код на python.
2. Вы хотите создать продукт для переваривания?
Ответ №1:
combinations =[(484.5, 1036.3, 2267.6),
(397.5, 2267.6, 475.6, 647.7),
(484.5, 1036.3, 811.9, 1455.7),
(397.5, 475.6, 811.9, 647.7, 1455.7)]
m = {3125.4: 'SKEPFKTRIDKKPCDHNTEPYMSGGNY',
1963.4: 'KMITKARPGCMHQMGEY',
397.5: 'AINV',
484.5: 'QIQD',
1036.3: 'YAINVMQCL',
2267.6: 'IEEATHMTPCYELHGLRWV',
475.6: 'MQCL',
1724.0: 'HMTPCYELHGLRWV',
2000.2: 'DHTAQPCRSWPMDYPLT',
811.9: 'IEEATHM',
1397.7: 'MVGKMDMLEQYA',
681.8: 'GWPDII',
647.7: 'QIQDY',
2174.4: 'TPCYELHGLRWVQIQDYA',
1794.0: 'HGLRWVQIQDYAINV',
1040.3: 'KKKNARKW',
1455.7: 'TPCYELHGLRWV'}
[tuple(m[i] for i in c) for c in combinations]
Вывод
[('QIQD', 'YAINVMQCL', 'IEEATHMTPCYELHGLRWV'),
('AINV', 'IEEATHMTPCYELHGLRWV', 'MQCL', 'QIQDY'),
('QIQD', 'YAINVMQCL', 'IEEATHM', 'TPCYELHGLRWV'),
('AINV', 'MQCL', 'IEEATHM', 'QIQDY', 'TPCYELHGLRWV')]