Как вы интегрируете поддержку GPU с Dask Gateway?

#dask #dask-distributed #dask-ml #dask-kubernetes #dask-gateway

#dask #dask-распределенный #даск-мл #dask-kubernetes #dask-gateway

Вопрос:

В настоящее время мы используем Dask Gateway с рабочими, работающими только с процессором. Однако в будущем, когда глубокое обучение получит более широкое распространение, мы хотим перейти к добавлению поддержки GPU для кластеров, созданных через Dask Gateway.

Я проверил документацию Dask Gateway, и там не так много подробных инструкций о том, как это настроить и какие части диаграммы / конфигурации helm нам нужно изменить, чтобы включить эту функциональность.

Я имею в виду сначала добавить графический процессор в кластер GKE на GCP, а затем использовать dockerfile RAPIDS для рабочих dask, которые используют этот графический процессор? Это все настройки, необходимые для Dask Gateway?

Был бы признателен, если бы кто-нибудь указал мне правильное направление.

Комментарии:

1. Я добавил ответ на основную часть вашего вопроса. Я рекомендую вам открыть отдельный вопрос о необходимости использования графических процессоров для SciKeras, Skorch и т. Д.

2. Спасибо миллион @JacobTomlinson. Я обязательно это сделаю. Мой последний вопрос был бы для нашей организации, вы рекомендуете нам иметь 2 экземпляра Gateway: один с вычислениями на процессоре, а другой для вычислений на GPU? Или может ли экземпляр gateway с вычислениями на GPU потенциально заменить экземпляр с вычислениями на CPU?

3. Честно говоря, я не уверен. Было бы хорошо, если бы у Gateway была концепция профилей, чтобы вы могли выбирать разные конфигурации кластеров (возможно, вы могли бы поднять вопрос GitHub, чтобы предложить это). Я думаю, что сегодня самый простой способ действий — иметь несколько шлюзов.

Ответ №1:

Для запуска кластера Dask на Kubernetes, способного выполнять вычисления на GPU, вам необходимо следующее:

  • Узлам Kubernetes нужны графические процессоры и драйверы. Это можно настроить с помощью плагина для устройств NVIDIA k8s.
  • Для планировщика и рабочих модулей потребуется образ Docker с установленными инструментами NVIDIA. Как вы предполагаете, изображения RAPIDS хороши для этого.
  • Для спецификации контейнера pod потребуются ресурсы GPU, такие как resources.limits.nvidia.com/gpu: 1
  • Рабочие Dask необходимо запускать с dask-cuda-worker помощью команды из dask_cuda пакета (который включен в изображения RAPIDS).

Примечание: для Dask Gateway ваш образ контейнера также нуждается в dask-gateway установке пакета. Мы можем настроить его для установки во время выполнения, но, вероятно, лучше создать пользовательский образ с установленным этим пакетом.

Поэтому вот минимальная конфигурация шлюза Dask, которая даст вам кластер GPU.

 # config.yaml
gateway:
  backend:
    image:
      name: rapidsai/rapidsai
      tag: cuda11.0-runtime-ubuntu18.04-py3.8  # Be sure to match your k8s CUDA version and user's Python version

    worker:
      extraContainerConfig:
        env:
          - name: EXTRA_PIP_PACKAGES
            value: "dask-gateway"
        resources:
          limits:
            nvidia.com/gpu: 1  # This could be >1, you will get one worker process in the pod per GPU

    scheduler:
      extraContainerConfig:
        env:
          - name: EXTRA_PIP_PACKAGES
            value: "dask-gateway"
        resources:
          limits:
            nvidia.com/gpu: 1  # The scheduler requires a GPU in case of accidental deserialisation

  extraConfig:
    cudaworker: |
      c.ClusterConfig.worker_cmd = "dask-cuda-worker"
 

Мы можем протестировать работу, запустив Dask gateway, создав кластер Dask и выполнив некоторую работу, специфичную для GPU. Вот пример, в котором мы получаем версию драйвера NVIDIA от каждого рабочего.

 $ helm install dgwtest daskgateway/dask-gateway -f config.yaml
 
 In [1]: from dask_gateway import Gateway

In [2]: gateway = Gateway("http://dask-gateway-service")

In [3]: cluster = gateway.new_cluster()

In [4]: cluster.scale(1)

In [5]: from dask.distributed import Client

In [6]: client = Client(cluster)

In [7]: def get_nvidia_driver_version():
   ...:     import pynvml
   ...:     return pynvml.nvmlSystemGetDriverVersion()
   ...: 

In [9]: client.run(get_nvidia_driver_version)
Out[9]: {'tls://10.42.0.225:44899': b'450.80.02'}
 

Комментарии:

1. Большое спасибо @JacobTomlinson. Это чрезвычайно полезная информация.