#r #dendrogram #dendextend
#r #дендрограмма #dendextend
Вопрос:
df <- scale(mtcars) # Standardize the data
library("factoextra")
library("cluster")
dist <- dist(df, method = "euclidean") # df = standardized data
hc <- hclust(dist, method = "ward.D2")
fviz_dend(hc, k = 4, # Cut in four groups
cex = 0.6, # label size
k_colors = "jco",
color_labels_by_k = TRUE, # color labels by groups
rect = TRUE, # Add rectangle around groups
rect_border = "jco",
rect_fill = TRUE,
rotate = TRUE)
Привет, новичок в r, мои вопросы;
- Я хочу, чтобы дендрограмма двигалась по часовой стрелке, как показано на рисунке ниже, как я могу создать горизонтальные метки ylab в дендрограмме
- Как я могу уменьшить пространство между метками оси и метками оси, которые я использовал для данных mtcars
Ответ №1:
Следуя моему приведенному выше вопросу, я нашел код для поворота меток ylab в dendrogram. Публикуя здесь, это может быть полезно другим.
library("ggdendro", "dendextend")
ggdendrogram(hc) theme_minimal(16)
coord_flip()
theme(panel.grid.major.y = element_blank(),
panel.grid.minor.y = element_blank())
library(dendextend)
hc %>%
as.dendrogram %>%
set("branches_k_color", k = 3) %>%
set("branches_lwd", 1.2) %>%
as.ggdend( ) %>%
ggplot(horiz=TRUE,
offset_labels = -2.8 )
theme_minimal(16)
labs(x = "Y",
y = "X")
scale_y_continuous(position = "left")
theme(axis.text.y = element_blank(),
panel.grid.major.y = element_blank(),
panel.grid.minor.y = element_blank())