RecordIO: «Заголовок записи MXNet RecordIO … не начинается с действительного магического числа»

#machine-learning #amazon-s3 #amazon-sagemaker #mxnet

#машинное обучение #amazon-s3 #amazon-sagemaker #mxnet

Вопрос:

Используя Linear Learner в Sagemaker с MXNet RecordIO, я получаю "The header of the MXNet RecordIO record at position 5,089,840 in the dataset does not start with a valid magic number" после fit() того, как прошло 38 минут.

Файл был сгенерирован с использованием этого кода. Обратите внимание, что я попробовал два способа загрузки в S3. Я также попробовал прямую загрузку BytesIO , а также загрузку файла, показанного здесь.

 train_file = 'linear_train.data'

f = io.BytesIO()
smac.write_numpy_to_dense_tensor(f, train_X.astype('float32'), train_y.astype('float32'))
f.seek(0)
 
# Write the stuff
with open(train_file, "wb") as fl:
    fl.write(f.getvalue())

# Alternative for upload
# boto3.Session().resource('s3').Bucket(bucket).Object(os.path.join(prefix, 'train', train_file)).upload_fileobj(f)
boto3.client('s3').upload_file(train_file,
                                  Bucket=bucket,
                                  Key=os.path.join(prefix, 'train', train_file),
                                  ExtraArgs={'ACL': 'bucket-owner-full-control'})
  

Чтобы проверить, что файл не поврежден, я загрузил его с S3 и просто прочитал его следующим образом.

    record = MXRecordIO(fl, 'r')
   while True:
      item = record.read()
      # Here we print the item, break when we reach the end, etc. This confirms that the RecordIO is valid.
  

Итак, файл выглядит нормально.

Как я могу запустить Linear Learner?

Вот сообщение об ошибке:

 Failure reason if any: ClientError: Unable to read data channel 'train'. Requested content-type is 'application/x-recordio-protobuf'. Please verify the data matches the requested content-type. (caused by MXNetError)

Caused by: [17:04:49] /opt/brazil-pkg-cache/packages/AIAlgorithmsCppLibs/AIAlgorithmsCppLibs-2.0.3446.0/AL2012/generic-flavor/src/src/aialgs/io/iterator_base.cpp:100: (Input Error) The header of the MXNet RecordIO record at position 5,089,840 in the dataset does not start with a valid magic number.

Stack trace returned 10 entries:
[bt] (0) /opt/amazon/lib/libaialgs.so( 0xbca0) [0x7f337885cca0]
[bt] (1) /opt/amazon/lib/libaialgs.so( 0xbffa) [0x7f337885cffa]
[bt] (2) /opt/amazon/lib/libaialgs.so(aialgs::iterator_base::Next() 0x4a6) [0x7f33788675e6]
[bt] (3) /opt/amazon/lib/libmxnet.so(MXDataIterNext 0x21) [0x7f3367272141]
[bt] (4) /opt/amazon/python2.7/lib/python2.7/lib-dynload/_ctypes.so(ffi_call_unix64 0x4c) [0x7f3378893958]
[bt] (5) /opt/amazon/python2.7/lib/python2.7/lib-dynload/_ctypes.so(ffi_call 0x15f) [0x7f33
Failed 39.0 min; Failure reason if any: ClientError: Unable to read data channel 'train'. Requested content-type is 'application/x-recordio-protobuf'. Please verify the data matches the requested content-type. (caused by MXNetError)

Caused by: [17:04:49] /opt/brazil-pkg-cache/packages/AIAlgorithmsCppLibs/AIAlgorithmsCppLibs-2.0.3446.0/AL2012/generic-flavor/src/src/aialgs/io/iterator_base.cpp:100: (Input Error) The header of the MXNet RecordIO record at position 5,089,840 in the dataset does not start with a valid magic number.

Stack trace returned 10 entries:
[bt] (0) /opt/amazon/lib/libaialgs.so( 0xbca0) [0x7f337885cca0]
[bt] (1) /opt/amazon/lib/libaialgs.so( 0xbffa) [0x7f337885cffa]
[bt] (2) /opt/amazon/lib/libaialgs.so(aialgs::iterator_base::Next() 0x4a6) [0x7f33788675e6]
[bt] (3) /opt/amazon/lib/libmxnet.so(MXDataIterNext 0x21) [0x7f3367272141]
[bt] (4) /opt/amazon/python2.7/lib/python2.7/lib-dynload/_ctypes.so(ffi_call_unix64 0x4c) [0x7f3378893958]
[bt] (5) /opt/amazon/python2.7/lib/python2.7/lib-dynload/_ctypes.so(ffi_call 0x15f) [0x7f33
  

Ответ №1:

Это произошло из-за файлов CSV в той же папке S3, что и RecordIO.