Подсчет больших двоичных объектов (ядер клеток) в 3D-изображении, марширующие кубы vtk

#python #vtk

#python #vtk

Вопрос:

Я пытаюсь подсчитать ядра клеток из 3D-изображения, которое я визуализировал, используя фильтр марширующих кубов vtk. Изображение здесь прикрепленное изображениеявляется результатом обработки с помощью vtk.marchingcubes. Есть ли у vtk какие-либо встроенные функции, помогающие подсчитывать большие двоичные объекты на изображении?

Я изо всех сил пытаюсь найти хорошие ресурсы, если бы кто-нибудь мог указать мне хорошее направление, это было бы также высоко оценено.

Спасибо!

Ответ №1:

Может быть, вы можете взглянуть на опцию vtkConnectivityFilter with SetExtractionModeToAllRegions() . Затем вы можете дополнительно оценить размер больших двоичных объектов по их объему или поверхности. Это пример того, как это делается в vedo :

введите описание изображения здесь