Блог

Я создал цикл for, который перебирает папку. Папка называется Ultrasonic data — Plots и содержит вложенные папки. Имена вложенных папок непротиворечивы, как и данные во вложенных папках. Когда я запускаю код, он работает очень хорошо для большинства циклов, но для некоторых вложенных папок выдает ошибку.

Ошибка: file (file, «rt»): не удается открыть соединение.

Ответы, которые я прочитал, обычно указывают на проблему как на неверно указанный рабочий каталог. Однако я думаю, что в этом примере это не так. Может ли что-нибудь еще вызвать это сообщение об ошибке?

Я уже проверил соответствие имен вложенных папок и файлов данных .txt в них.

 '''R  
parent.folder <- "//home.org.aalto.fi/meijsl1/data/Documents/GAGS/Ultrasonic data/Ultrasonic data - Plots"  
sub.folders <- list.dirs(parent.folder, recursive=FALSE)  
filt.folders <- sub.folders[grepl("SV-30-[^_]*_S[12]", sub.folders)]  

for(i in filt.folders) {  
  setwd(i)  
  AIC("SV-30", 20, 40) #This is a function that picks the S-wave onset of an ultrasonic signal  
}   #End for loop over all specimens
'''


'''PArt of the AIC function where the error occurs: (read.table)    
  for (n in 1:length(filelist)){  
    #  
    # Read the file into R  
    #  
    file.path('./out/Processed', basename(filelist[n])) -> procpath  
    read.table(file=procpath, sep="t", stringsAsFactors=FALSE, check.names = FALSE) -> temp  
    assign(paste(substr(basename(filelist[n]), 1, nchar(basename(filelist[n]))   - 4)), temp)  
'''
  

Код должен выполняться плавно, как и для большинства вложенных папок, но, по-видимому, что-то не так. У меня нет идей, что это может быть. С моей точки зрения, согласованность была единственной вещью, которая могла вызвать эту проблему. Я надеюсь, что кто-нибудь может помочь.

Приветствия