#r #shiny #shiny-server #rmysql
#r #блестящий #shiny-сервер #rmysql
Вопрос:
У меня возникли некоторые проблемы с публикацией этого блестящего приложения. На мой вопрос я не думаю, что пользовательский интерфейс.R имеет значение. Вот server.R:
library(shiny)
library(RMySQL)
library(tidyverse)
library(colorspace)
library(ggplot2)
### CONNECT AND QUERY THE DATABASE
### uncomment the next line to reconnect to server amp; re-query the database
source("http://www.mvabl.com/Dashrock/MySQL_connect_query.R")
con <- dbConnect(MySQL(),
user = 'shiny_apps',
password = '####',
host = 'mysql.mvabl.com',
dbname='sandbox191')
qmain <- dbSendQuery(con, "SELECT * FROM sizes;")
sizes <- as.data.frame(dbFetch(qmain,n=-1),na.rm=TRUE)
### GENERATE GGPLOT
colors17 <- c("#9D8FAC","#8E96B0","#7F9BB0","#71A0AD","#67A5A7","#63A89E","#64AB94","#6BAC88","#77AD7B","#85AD70","#94AC66","#A4AA5F","#B5A75B","#C4A35B","#D39F5F","#DF9C67","#E99872")
colors6 <- c("#9D8FAC","#6FA1AC","#66AB8F","#8EAC6A","#C1A45A","#E99872")
sizes$Size_Cat <- factor(sizes$Size_Cat,
levels = c("n1_4","n5_9","n10_19",
"n20_49","n50_99","n100_249",
"n250_499","n500_999","n1000",
"n1000_1","n1000_2","n1000_3",
"n1000_4"))
sizes$market <- factor(sizes$market,
levels = c("NYC","LA","CHI","DC","SF","BOS"))
sizes <- sizes %>%
filter(market %in% c("NYC","SF"),
Size_Cat %in% c("n50_99","n100_249","n250_499"))
shinyServer(function(input, output) {
output$plot <- renderPlot({
g <- ggplot(sizes)
g geom_bar(stat = "identity",
position = "dodge",
aes_string(x=input$x, y=input$y))
if (input$color != 'None')
g <- g aes_string(color=input$color)
facets <- paste(input$facet_row, '~', input$facet_col)
if (facets != '. ~ .')
g <- g facet_grid(facets)
g <- g scale_fill_manual (values=colors17)
g <- g facet_wrap(~ input$facet_row)
g <- g labs( y = "Number of Companies", title = "Market Structure")
g <- g theme(strip.text.x = element_text(size = 8),
axis.text.x = element_text(angle=90, size=6))
if (input$jitter)
g <- g geom_jitter()
if (input$smooth)
g <- g geom_smooth()
print(g)
}, height=700)
})
dbHasCompleted(qmain)
dbClearResult(qmain)
dbDisconnect(con)
Результат, который я получаю, — «Размеры объекта не найдены»
Дело в том, что когда я запускаю точно такой же код локально, но без блестящей части, я получаю ожидаемый результат. Вот этот код:
library(RNeo4j)
library(tidyverse)
library(stringr)
library(MASS)
library(RColorBrewer)
library(colorspace)
### uncomment the next 2 lines to reconnect to server amp; re-query the database
setwd("~/Desktop/Dashrock/")
source("http://www.mvabl.com/Dashrock/MySQL_connect_query.R")
colors17 <- c("#9D8FAC","#8E96B0","#7F9BB0","#71A0AD","#67A5A7","#63A89E","#64AB94","#6BAC88","#77AD7B","#85AD70","#94AC66","#A4AA5F","#B5A75B","#C4A35B","#D39F5F","#DF9C67","#E99872")
colors6 <- c("#9D8FAC","#6FA1AC","#66AB8F","#8EAC6A","#C1A45A","#E99872")
sizes$Size_Cat <- factor(sizes$Size_Cat,
levels = c("n1_4","n5_9","n10_19",
"n20_49","n50_99","n100_249",
"n250_499","n500_999","n1000",
"n1000_1","n1000_2","n1000_3",
"n1000_4"))
sizes$market <- factor(sizes$market,
levels = c("NYC","LA","CHI","DC","SF","BOS"))
sizes <- sizes %>%
filter(market %in% c("NYC","SF"),
Size_Cat %in% c("n50_99","n100_249","n250_499"))
g <- ggplot(sizes)
g geom_bar(stat = "identity",
position = "dodge",
aes(x = market,
y = firms,
fill = industry),
color = "grey")
scale_fill_manual (values=colors17)
facet_wrap(~ Size_Cat)
labs( y = "Number of Companies", title = "Market Structure")
theme(strip.text.x = element_text(size = 8),
axis.text.x = element_text(angle=90, size=6))
Исходный файл «connection» доступен для публичного просмотра в Интернете по адресу http://www.mvabl.com/Dashrock/MySQL_connect_query.R (точно такой же URL-адрес из приведенных выше блоков кода), но я хэшировал PW, так что это не исполняемый файл. (Я не знаю, как замаскировать пароль для доступа кода к моей БД.)
Наконец, в обоих моих сторонних клиентах MySQL (Sequel Pro и MySQL Workbench) sizes
таблица отображается без проблем.
Кто-нибудь может определить проблему? Или, что еще лучше, скажите мне, как я могу сам это диагностировать?
Спасибо
Комментарии:
1. Отображается ли в сообщении об ошибке, в какой строке произошла ошибка?
2. Нет. Он просто открывается на вкладке браузера с этим сообщением об ошибке. А в RStudio вообще нет информации об ошибках. Я попытался добавить строку
test1 <- "PASSED"
в разных местах, чтобы посмотреть, смогу ли я найти, где произошел сбой кода. (Я не знаю никаких функций трассировки ошибок в R). Это не помогло.3. Посмотрите, если это shiny.rstudio.com/articles/debugging.html помогает. Также, вероятно, будет полезно, если вы опубликуете код пользовательского интерфейса
Ответ №1:
У меня было что-то подобное раньше. Попробуйте заменить
g <- ggplot(sizes)
с
g <- ggplot(sizes())
Комментарии:
1. Спасибо! Это сработало. Я никогда, никогда бы не подумал об этом.