Блог

Я пытаюсь установить R-пакет ‘deSolve’ в Jupyter notebook, но я получаю следующую ошибку:

 > install.packages("deSolve")
Warning message in install.packages("deSolve"):
“installation of package ‘deSolve’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done
  

Я получаю точно такое же сообщение об ошибке при попытке установить любой пакет (я пробовал tidyverse, lubridate и RCurl). Я совершенно новичок в ноутбуках Jupyter, но раньше использовал R. Есть ли другой способ установки пакетов с помощью ноутбука?

• Я использую Jupyter Labs через Anaconda «из коробки».
• Я создал среду R и запустил Jupyter Labs с активированной средой.
• Я использую R версии 3.6.1

Ценю любую помощь, которую вы можете оказать по этому вопросу. И, пожалуйста, дайте мне знать, какая дополнительная информация вам нужна для диагностики. Спасибо!

Выяснилось, что вы можете сделать это с помощью Anaconda Navigator, выбрав среду, которую вы используете, а затем выбрав пакеты для установки.

В ноутбуке

 load_ext rpy2.ipython

import rpy2.robjects.packages as repackages

utils = repackages.importr(‘utils’)

utils.chooseCRANmirrow(ind=1) #select mirrow

packnames = (‘deSolve’)
from rpy2.robjects.vectors import StrVector

utils.install_packages(StrVector(packages))