Как сгенерировать матрицу Маркова из приведенного ниже графика?

#cytoscape

#cytoscape

Вопрос:

Я использую программное обеспечение CytoScape. У него есть возможность автоматически создавать кластер MCL, но у меня возникают трудности с просмотром связанной матрицы. Кто-нибудь знает, как получить это с помощью Cytospace?

кластер mcl, созданный с использованием clustermaker2

Ответ №1:

Приложение clusterMaker2 для Cytoscape выполняет кластеризацию MCL, но оно не обеспечивает вывод для промежуточных шагов, таких как начальная матрица сети. Однако для Cytoscape существует приложение, которое может экспортировать матричную версию любой заданной сети: http://apps.cytoscape.org/apps/adjexporter .