Блог

Главная - Вопросы по программированию - ошибка при установке vegan в r

ошибка при установке vegan в r

#r #vegan

#r #vegan

Вопрос:

Когда я попытался установить vegan с помощью install.packages("vegan") и с помощью RStudio, я получаю следующее сообщение об ошибке

 * installing *source* package ‘vegan’ ...
** package ‘vegan’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector-strong  -c cepin.f -o cepin.o
/bin/bash: gfortran: command not found
/usr/lib/R/etc/Makeconf:157: recipe for target 'cepin.o' failed
make: *** [cepin.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package ‘vegan’
* removing ‘/home/stephy/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/vegan’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘vegan’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpoFztoS/downloaded_packages’

Ответ №1:

Вам необходимо установить GFortran и убедиться, что он находится на вашем пути.

Вы можете загрузить его двоичный файл для своей ОС отсюда:

https://gcc.gnu.org/wiki/GFortranBinaries

Поскольку вы используете Linux после его загрузки, вы можете установить его следующим образом:

 tar -xzvf gfortran-4.5-linux-i686.tar.gz -C /

Затем добавьте его в свой PATH vegan и повторите попытку установки.

Комментарии:

1. Или используйте свой менеджер пакетов, например sudo apt-get install gfortran , или что-то подобное, если вы используете Ubuntu или другой дистрибутив, производный от Debian.

2. Да, хороший момент yum или что-то еще. Я не знаю, в каком дистрибутиве они находятся, и не хотел добавлять дополнительные инструкции, чтобы убедиться, что их менеджер пакетов обновлен ( apt get update И т. Д.).

3. я не знаю, является ли это формой благодарности. это сработало.

4. @stephy Рад, что это сработало! Если вы хотите сказать спасибо, вы можете просто поставить зеленую галочку рядом с ответом, чтобы пометить его как решение 😉