#r #r-caret #confusion-matrix
#r #r-каретка #путаница-матрица
Вопрос:
Допустим, у меня есть матрица
> a <- matrix(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9),nrow=3)
> rownames(a)=c('A','B','C')
> colnames(a)=c('A','B','C')
> a
A B C
A 1 4 7
B 2 5 8
C 3 6 9
Учитывая, что столбцы будут представлять фактический класс, а строки — прогнозируемый класс, как я могу извлечь векторы прогнозов и фактических значений, чтобы использовать их в confusionMatrix()?.
Ответ №1:
Я предполагаю, что вы имеете в виду confusionMatrix()
from caret
. Это уже матрица путаницы, и вы можете просто передать прогнозы в функцию, используя as.table() , см. Пример, где мы настраиваем модель и обучаем / тестируем данные:
library(caret)
set.seed(111)
idx = sample(1:nrow(iris),100)
trainData = iris[idx,]
testData = iris[-idx,]
mdl = train(Species ~ .,data=trainData,
method="rf",trControl=trainControl(method="cv"))
pred = predict(mdl,testData)
actual = testData$Species
Матрица путаницы с метками:
confusionMatrix(pred,actual)
Confusion Matrix and Statistics
Reference
Prediction setosa versicolor virginica
setosa 20 0 0
versicolor 0 11 2
virginica 0 0 17
Матрица путаницы с таблицей или матрицей :
a = matrix(table(pred,actual),nrow=3)
colnames(a) = levels(testData$Species)
rownames(a) = levels(testData$Species)
setosa versicolor virginica
setosa 20 0 0
versicolor 0 11 2
virginica 0 0 17
confusionMatrix(as.table(a))
Confusion Matrix and Statistics
setosa versicolor virginica
setosa 20 0 0
versicolor 0 11 2
virginica 0 0 17
Overall Statistics
Accuracy : 0.96
95% CI : (0.8629, 0.9951)
No Information Rate : 0.4
P-Value [Acc > NIR] : < 2.2e-16
Если они вам действительно нужны в векторе (для меня это звучит очень странно), используя:
actual_vector = rep(colnames(a),colSums(a))
pred_vector = rep(rownames(a),rowSums(a))
table(actual_vector) == table(actual)
actual_vector
setosa versicolor virginica
TRUE TRUE TRUE
table(pred_vector) == table(pred)
pred_vector
setosa versicolor virginica
TRUE TRUE TRUE
Комментарии:
1. Я имел в виду пакет caret, и он отлично работает для функции confusionMatrix, спасибо. Я на самом деле спросил о получении векторов из матрицы, потому что я мог бы также использовать их для других функций в пакете, которые не могут принимать объект matrix(table (a)), так что вы знаете, как / если это можно сделать относительно простым способом?