#r #docker #deepnote
#r #docker #deepnote
Вопрос:
Я настроил пользовательскую среду с ядром R в Deepnote, и я хочу использовать Dockerfile для установки пакета mosaic (в противном случае мне приходится устанавливать его вручную каждый день, и это занимает некоторое время). Когда я добавляю
RUN R -e 'install.packages("mosaic")'
после IRkernel::installspec
строки в Dockerfile я получаю следующий вывод:
Step #1: > install.packages("mosaic")
Step #1: Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
Step #1: (as ‘lib’ is unspecified)
Step #1: Warning in install.packages("mosaic") :
Step #1: 'lib = "/usr/local/lib/R/site-library"' is not writable
Step #1: Error in install.packages("mosaic") : unable to install packages
Step #1: Execution halted
Step #1: The command '/bin/sh -c R -e 'install.packages("mosaic")'' returned a non-zero code: 1
Finished Step #1
ERROR
ERROR: build step 1 "gcr.io/cloud-builders/docker" failed: step exited with non-zero status: 1
Step #1:
Что я делаю не так?
Ответ №1:
Пример, на который вы ссылаетесь, содержит sudo
:
RUN sudo apt-get update amp;amp;
sudo apt-get install -y r-base
RUN sudo R -e "install.packages('IRkernel', repos='http://cran.rstudio.com/')"
^^^^
Вероятно, вам это тоже понадобится, поскольку вы получите is not writable
сообщение.
Комментарии:
1. Спасибо, это сделало свое дело! Мне также пришлось добавить команду
repos='http://cran.rstudio.com/'
для установки.