Блог

Я использую эту командную строку для создания файла в режиме добавления, с целью простого добавления новых строк при повторном запуске скрипта. Но как я могу написать заголовок при создании файла?

Это моя команда:

 out_summary_file=os.environ["output_file"]

for sampleId in sampleList:
    pathology = pathology(sampleId)
    insulin_rate = insulin_rate(sampleId, threshold)
    with open(out_summary_file, 'a') as outFile:
        outFile.write('{}t{}t{}n'.format(sampleId, pathology, insulin_rate))
  

Моя цель — получить файл с другой строкой для каждого SampleID, состоящий из 3 столбцов:

 sampleId    pathology    insulin_rate

sampleA     colorrectal  high
sampleB     lung         normal
.           .            .
  

В зависимости от новых данных мне может быть интересно добавить информацию в уже существующий выходной файл или создать новый. Итак, как я могу автоматически записывать заголовок при создании нового файла, просто добавляя при использовании ранее существующего файла?

Вы можете сначала проверить, существует ли файл. Если это произойдет, просто добавьте. Если это не так, создайте его с заголовком.

 import os

if os.path.isfile(filename):
    # file exists, just append
else:
    # file doesn't exist, create with header