#python #numpy #image-processing #scipy
#python #numpy #обработка изображений #scipy
Вопрос:
У меня есть стопка спутниковых снимков, которые все сделаны за короткий период времени, но ни один из них не обеспечивает достаточного охвата моей области исследования. Поэтому я хотел бы:
- Усредняйте их все вместе — игнорируя nan, если в этом местоположении есть хотя бы одна другая допустимая точка данных
- интерполируйте по массиву, чтобы заполнить пробелы — если только нет допустимой точки данных с n пикселями этого местоположения. Если это так, я просто сохраню его как nan и проигнорирую его при окончательной обработке.
Пока у меня есть:
initial_satellite_data.shape
>>> (5, 500, 500, 2)
# This is five images, 500x500 pixels, and two bands per image.
# need to convert this to float in order to do the next step
sat_data_float = initial_satellite_data.astype(np.float32)
# 255 values signify areas without data, so converting that to nan
sat_data_float[sat_data_float==255]=np.nan
# get the average across the different images
average_image = np.nanmean(np_imageset, axis=0)
average_image.shape
>>> (500, 500, 2)
Но я не совсем понимаю, как я могу интерполировать данные, чтобы заполнить пробелы, которые все еще содержат данные nan, вместе с моим предостережением о нежелании интерполировать, если у пикселя нет действительных данных с n-пикселями.
В качестве примера того, как примерно могут отображаться данные, вот некоторый код, генерирующий вид шума, который я хочу интерполировать, и вид отсутствующих фрагментов, которые я не хочу интерполировать на изображении с одним диапазоном:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
x = np.linspace(0, 1, 500)
y = x[:, None]
average_image = x y
# Destroy some values - this is about the amount of missing
# data I have that I want to interpolate across
mask = np.random.random(average_image.shape) > 0.98
average_image[mask] = np.nan
# Now destroy a whole corner that might be missing and it
# doesn't make sense to interpolate into this mass of missing data
average_image[0:80, 0:80] = np.nan
# Here should be some interpolation process, I've been able to interpolate in 1D across the row and that actually works well
# enough to get rid of the missing individual pixels but I can't do a sanity check to make sure it isn't interpolating a pixel 50 pixels away from real data.
interpolated_image = average_image
fig, (ax0, ax1) = plt.subplots(1, 2)
ax0.imshow(average_image, cmap='gray', interpolation='nearest')
ax0.set_title('Input image')
ax1.imshow(interpolated_image, cmap='gray', interpolation='nearest')
ax1.set_title('Interpolated data')
plt.show()
Комментарии:
1. вы можете использовать окрестность nxn вокруг nan пикселей и присвоить этому пикселю среднее значение
2. Если вы поделитесь некоторыми данными и определите местоположение, где вы делаете интерполяцию, и местоположение, где вы не хотите ее выполнять, я попробую завтра. Также скажите мне
n
, измеряется ли оно горизонтально, вертикально или в каком-либо направлении.3. Привет @MarkSetchell, я добавил несколько примеров данных с подробностями. Я думаю,
n
должно быть 3 пикселя и измеряться в любом направлении.