#matlab #parallel-processing #openmp #mex
#matlab #параллельная обработка #openmp #mex
Вопрос:
Я новичок в OpenMP. У меня есть следующий код, который отлично компилируется с использованием Matlab mex, настроенного с MSVS2010. На компьютере доступно 8 процессоров (что я также проверил с помощью matlabpool).
#include "mex.h"
#include <omp.h>
typedef unsigned char uchar;
typedef unsigned int uint;
//Takes a uint8 input array and uint32 index array and preallocated uint8 array the same
//size as the first one and copies the data over using the indexed mapping
void mexFunction( int nlhs, mxArray *plhs[], int nrhs, const mxArray*prhs[] )
{
uint N = mxGetN(prhs[0]);
mexPrintf("n=%in", N); mexEvalString("drawnow");
uchar *input = (uchar*)mxGetData(prhs[0]);
uint *index = (uint*)mxGetData(prhs[1]);
uchar *output = (uchar*)mxGetData(prhs[2]);
uint nThreads, tid;
#pragma omp parallel private(tid) shared(input, index, output, N, nThreads) num_threads(8)
{
tid = omp_get_thread_num();
if (tid==0) {
nThreads = omp_get_num_threads();
}
for (int i=tid*N/nThreads;i<tid*N/nThreads N/nThreads;i ){
output[i]=input[index[i]];
}
}
mexPrintf("nThreads = %in",nThreads);mexEvalString("drawnow");
}
Результат, который я получаю, это
n=600000000
nThreads = 1
Почему создается только один поток, несмотря на то, что я запрашиваю 8?
Ответ №1:
Вздох. Как правило, тратите часы на попытки и неудачи, а затем находите ответ через 5 минут после публикации в SO.
Файл должен быть обработан с поддержкой openmp
mex mexIndexedCopy.cpp COMPFLAGS="/openmp $COMPFLAGS"
Комментарии:
1. Я знаю это чувство, брат.
2. какой эквивалентный вариант под Linux с gcc в качестве компилятора?
-fopenmp
?3. @linello Да. На самом деле я просто потратил пару часов впустую, потому что неправильно сдавал
-fopenmp
. Вам нужно передать его как компилятору, так и компоновщику.mex CXXFLAGS="$CXXFLAGS -fopenmp" LDFLAGS="$LDFLAGS -fopenmp" [other options] <file.cpp>
для C . (Для C используйтеCFLAGS
вместоCXXFLAGS
; как для C, так и для C используйте оба.)4. Действительно @SchighSchagh. На компьютере с Linux я должен был убедиться, что
-fopenmp
был на каждом этапе компиляции, поэтому у меня сработало то, чтоmex CFLAGS='$CFLAGS -fopenmp' LDFLAGS='$LDFLAGS -fopenmp' COPTIMFLAGS='$COPTIMFLAGS -fopenmp -O2' LDOPTIMFLAGS='$LDOPTIMFLAGS -fopenmp -O2' DEFINES='$DEFINES -fopenmp' -v functionName.F
гдеDEFINES
используется только для того, чтобы убедиться, что-fopenmp
дошло до первой строки компиляции.