#r #seurat
#r #серат
Вопрос:
Я пытаюсь открыть файл, но, похоже, я сталкиваюсь с ошибкой.
Вот что я делаю в RStudio:
file <- readRDS("~/Downloads/file.rds")
View(file)
И затем я получаю эту ошибку:
Ошибка при оценке (вызов(«@», объект, слот)): нет слота с именем «изображения» для этого объекта класса «Seurat»
Для файла RDS требуется Seurat, но у меня он установлен правильно. Я не уверен, как интерпретировать это сообщение об ошибке. Спасибо
Комментарии:
1. Возможно, это было сделано с другой версией Seurat? Интересно, могла ли измениться структура объекта (просто предположение). Была ли разница между тем, когда вы создавали rds и когда вы его открывали? Или это происходит со всеми объектами, которые вы создаете с помощью Seurat?
2. Теперь, когда вы упомянули об этом, это было сделано с другой версией Seurat. Если проблема в этом, есть ли более простой способ ее исправить, кроме удаления текущей версии Seurat и перехода на более старую?
Ответ №1:
попробуйте обновить объект seurat:
pmbc.updated = UpdateSeuratObject(объект = pmbc)