#python #linux #anaconda #conda #cupy
#python #linux #anaconda #conda #cupy
Вопрос:
Я на Ubuntu 18.04 (64-разрядная версия) и пытался использовать функцию, которая использует cupy для повторной выборки некоторых данных, но получила ошибку AttributeError: type object 'cupy.core.core.Indexer' has no attribute '__reduce_cython__'
. Я видел проблему на github с той же ошибкой, которая предполагала, что это было из-за несоответствия версии или отсутствующей зависимости.
Сначала я попытался обновить cupy с помощью conda, но затем, когда я попытался импортировать cupy, я получил сообщение об ошибке, что cupy установлен неправильно, и предложил попробовать pip install cupy --no-cache-dir -vvvv
это исправить. Похоже, это не сработало, и папка в site-packages по какой-то причине называлась ~ upy (при выполнении этой команды было много выходных данных / ошибок, но я не уверен, где она сохранила бы эти сообщения).
Я попытался запустить nvcc --version
, как предложено в выпуске, чтобы проверить мою версию cuda, но получил сообщение об ошибке, что nvcc была нераспознанной командой. Ранее у меня работал cupy / CUDA, но я попытался обновить cuda с помощью sudo apt install nvidia-cuda-toolkit
. Теперь nvcc работает и выводит Cuda compilation tools, release 9.1, V9.1.85
. (Обратите внимание, что в /usr /local /cuda version.txt в файле указано «Версия CUDA 10.1.168».)
Я все еще получал ошибки, поэтому я попытался sudo apt-get --purge remove "*cublas*" "*cufft*" "*curand*" "*cusolver*" "*cusparse*" "*npp*" "*nvjpeg*" "cuda*" "nsight*"
и conda uninstall cupy
удалить файлы, чтобы начать заново, но затем я узнал о --revisions
аргументе для conda. Теперь я пытаюсь вернуться к версии 11, но получаю следующий результат:
PackagesNotFoundError: The following packages are missing from the target environment:
- conda-forge/linux-64::gnutls==3.6.13=h79a8f9a_0
- conda-forge/linux-64::openh264==2.1.1=h8b12597_0
- anaconda/linux-64::cupti==10.1.168=0
- conda-forge/linux-64::openssl==1.1.1g=h516909a_0
- anaconda/linux-64::cudnn==7.6.5=cuda10.1_0
- anaconda/linux-64::tensorflow==2.2.0=gpu_py37h1a511ff_0
- conda-forge/linux-64::ca-certificates==2020.6.20=hecda079_0
- conda-forge/linux-64::conda==4.8.3=py37hc8dfbb8_1
- anaconda/linux-64::tensorflow-base==2.2.0=gpu_py37h8a81be8_0
- conda-forge/linux-64::nettle==3.4.1=h1bed415_1002
- anaconda/linux-64::cupy==6.0.0=py37hc0ce245_0
- anaconda/linux-64::cudatoolkit==10.1.243=h6bb024c_0
- anaconda/linux-64::_tflow_select==2.1.0=gpu
- conda-forge/linux-64::lame==3.100=h14c3975_1001
Прежде чем я продолжу, есть какие-либо предложения о том, как я должен это исправить? Теперь программа обновления программного обеспечения выдает мне сообщение об ошибке, в котором говорится, что система пакетов неисправна.
Check if you are using third party repositories. If so disable them, since they are a common source of problems.
Furthermore run the following command in a Terminal: apt-get install -f
Transaction failed: The package system is broken, with the rest of the message as follows:
The following packages have unmet dependencies:
nvidia-cuda-toolkit: Depends: nvidia-profiler (= 9.1.85-3ubuntu1) but 9.1.85-3ubuntu1 is installed
Depends: nvidia-cuda-dev (= 9.1.85-3ubuntu1) but it is not installed
Depends: opencl-dev but it is a virtual package
Depends: libgcc1 (>= 1:3.0) but 1:8.4.0-1ubuntu1~18.04 is installed
Поскольку я не документировал каждый шаг по мере его возникновения, вот список команд, которые я запустил, пытаясь исправить эту проблему, на случай, если это полезно или более показательно, чем то, что я упомянул выше:
485 pip list
486 pip freeze | grep cupy
487 nvcc --version
488 conda update cupy
489 conda install numba cudatoolkit pyculib
490 conda update cupy
491 uname -a
492 lspci | grep -i nvidia
493 uname -m amp;amp; cat /etc/*release
494 gcc --version
495 uname -r
496 cat /var/lib/apt/lists/*cuda*Packages | grep "Package:"
497 pip --update cupy
498 pip install cupy --upgrade
499 pip install cupy --no-cache-dir -vvvv
500 pip install cupy
501 nvcc --version
502 sudo apt install nvidia-cuda-toolkit
503 nvcc --version
504 conda install -c conda-forge cupy
505 pip freeze
506 sudo apt-get --purge remove "*cublas*" "*cufft*" "*curand*" "*cusolver*" "*cusparse*" "*npp*" "*nvjpeg*" "cuda*" "nsight*"
507 apt-get install -f
508 sudo apt-get install -f
509 conda uninstall cupy
510 conda list
511 conda list --revisions
512 conda env list
513 conda install --revision 11
514 conda list --revisions
515 conda install --revision 13
Исправлено путем удаления CUDA и cupy с последующей переустановкой.
Я выполнил шаги по удалению для CUDA, перечисленные в конце их инструкций по установке, наряду с некоторыми другими командами очистки из другого поста (я думаю, это был sudo apt-get --purge remove "*nvidia*"
). Я удалил папки ~ upy и ~ upy-6.0.0-py3.7.egg-info, которые были созданы ранее. Затем я снова прошел все инструкции по установке для CUDA и использовал conda forge для установки cudatoolkit и cupy. Выполнение рекомендуемых инструкций cupy на их сайте у меня не сработало, это привело к очень длительной ошибке после неудачной сборки wheel. Успешными командами были:
conda install -c nvidia cudatoolkit
conda install -c conda-forge cupy
Комментарии:
1. Можете ли вы поделиться содержимым среды? Вы пробовали все это в новых средах?
Ответ №1:
Для меня
conda install -c conda-forge cupy
понижен рейтинг cudatoolkit, установленного на предыдущем шаге, и до несуществующей версии cuda тоже.
Комментарии:
1. Это то, что он написал в конце вопроса…