#python #python-3.x #tensorflow #tensorflow-datasets #tensorflow2.0
#python #python-3.x #тензорный поток #tensorflow-наборы данных #tensorflow2.0
Вопрос:
Я пытаюсь реализовать конвейер ввода с помощью tf.data. Объекты находятся в матрице, экспортированной из matlab, в то время как метки находятся в других файлах, для чтения которых требуются определенные функции.
Имена файлов, которые должны быть загружены, могут быть вычислены с учетом числа.
Вот как я это реализовал
def load_files(k):
mesh_file = file_path(k, "off", flags.dataset_mesh)
mat_file = file_path(k, "mat", flags.dataset_mat)
mesh = pymesh.load_mesh(mesh_file)
mat = scipy.io.loadmat(mat_file)
return mesh.vertices, mat
def generator_fn():
return (load_files(x) for x in range(1000000 1))
def input_fn() -> Dataset:
dataset = tf.data.Dataset.from_generator(generator_fn,
output_types=(tf.as_dtype(tf.float32), tf.as_dtype(tf.float32)), )
dataset = dataset.batch(batch_size=flags.batch_size).repeat()
dataset = dataset.cache()
dataset = dataset.prefetch(buffer_size=flags.prefetch_buffer_size)
return dataset
Проблема в том, что использование графического процессора очень низкое, около 5% (2080 ti). Я не уверен, где находится узкое место.
Я тестирую с помощью простого MLP, но использование графического процессора, похоже, не меняется, несмотря на слои или нейроны на слой, которые я добавляю.
Я выполняю обучение таким образом:
model = keras.Sequential([
keras.layers.Flatten(input_shape=(n_input,)),
keras.layers.Dense(1024, activation=tf.nn.relu),
.
.
.
keras.layers.Dense(1024, activation=tf.nn.relu),
keras.layers.Dense(n_output, activation=None)
])
model.compile(optimizer='adam', loss='mean_squared_error')
model.fit(input_fn().make_one_shot_iterator(), steps_per_epoch=1000000, epochs=1)
Итак, я думаю, что проблема может заключаться в том, как я передаю данные (проблема не должна заключаться только в чтении файла, поскольку я использую SSD NVMe), в том, как я провожу обучение, или в том, что это всего лишь простая сеть, несмотря на слои, которые я добавляю.
Однако я хотел бы знать, существует ли более эффективный способ передачи данных.
Я использую tensorflow-gpu 2.0.0a0
, я запустил тест от lambda-labs, и он смог использовать графический процессор на 100%
Комментарии:
1. Попробуйте передать свои данные, используя какой-нибудь стандартный формат одного файла, такой как TFRecord или HDF5, который определенно поможет.
2. Какой тип данных
load_files
возвращает? Вы пробовали его профилирование? В каком формате файла хранятся данные в обоихfile_path
? Вам это не нужноinput_fn().make_one_shot_iterator()
Я думаю, проблема в этой строкеload_files(x) for x in range
3. Я немного занят на этой неделе, я определенно попытаюсь преобразовать весь набор данных (он довольно тяжелый, около 30 ГБ) в TFRecord. Мне не особенно нравится эта идея, поскольку я хотел бы сохранить совместимость данных с matlab, и я хотел бы максимально упростить создание набора данных.
load_files
возвращает две матрицы с плавающими значениями: одну с формой (n, 3), то есть вершины сетки, другую с формой (n,), то есть функцию, определенную в вершинах такой сетки. Я не знаю, как его профилировать, мне придется это проверить. Почему проблема должна быть в генераторе?4. Не меняется ли загрузка графического процессора при запуске
batch_size
?