чтение неориентированного графического csv-файла в R с помощью библиотеки statnet

#r #networking #undirected-graph #statnet

#r #сеть #неориентированный график #statnet

Вопрос:

У меня есть CSV-файл, в котором есть 2 столбца, первый и второй столбцы содержат узлы, каждая строка означает узлы ребра неориентированного графика. Я новичок в R, и это мой код:

 library(statnet)
dat <- read.csv('Slashdot081106_nosign.csv')
print(head(dat))
net <- as.network(dat, matrix.type="edgelist")
  

и консоль показывает:

   from to
1    0  1
2    0  2
3    0  3
4    0  4
5    0  5
6    0  6
Error in add.edges.network(g, as.list(x[, 1]), as.list(x[, 2]), edge.check = edge.check) : 
  (edge check) Illegal vertex reference in addEdges_R.  Exiting.
  

Я много искал информацию об этой ошибке, однако тщетно. Кто может сказать мне, как решить эту проблему?

Заранее спасибо!

Ответ №1:

На данный момент этому почти год, но я только что столкнулся с этой же проблемой, и мне посчастливилось найти решение.

Проблема в том, что для пакета statnet узлы в списке edgelist должны быть проиндексированы, начиная с 1, а не 0. Итак, если вы добавите 1 к идентификатору каждой вершины, это должно сработать. Приведенный ниже код должен сделать свое дело.

 library(statnet)
dat <- read.csv('Slashdot081106_nosign.csv')
new_dat <- dat   1
print(head(new_dat))
net <- as.network(new_dat, matrix.type="edgelist")