Создайте конвейер оболочки, запущенный из подпроцесса.Сбой Popen, если левая сторона трубы выходит из строя
#linux #bash #shell #subprocess Вопрос: Я запускаю команду bash с подпроцессом.popen на python: cmd = "bwa-mem2/bwa-mem2 mem -R '@RG\tID:2064-01\tSM:2064-01\tLB:2064-01\tPL:ILLUMINA\tPU:2064-01' reference_genome/human_g1k_v37.fasta BHYHT7CCXY.RJ-1967-987-02.2_1.fastq BHYHT7CCXY.RJ-1967-987-02.2_2.fastq -t 14 | samtools view -bS -o dna_seq/aligned/2064-01/2064-01.6.bam…